Preview

Biosafety and Biotechnology

Advanced search

DEVELOPMENT OF A REAL-TIME PCR TEST SYSTEM FOR THE DIAGNOSTICS OF BOVINE LUMPY SKIN DISEASE VIRUS

Abstract

Lumpy skin disease virus (LSDV) is currently one of the most harmful and economically significant diseases of cattle in many countries, including Kazakhstan. Due to the unfavorable situation in the country for this type of disease, a quick diagnosis of this virus is required for a timely response and taking the necessary measures. To solve these problems, a test system based on the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) method has been developed. When developing the test system, modern molecular biological methods were used, with the help of which the most conservative and specific regions of the GPCR gene of the LSDV were determined. Using the selected regions, species-specific pairs of primers and probes were designed and synthesized. For setting RT-PCR, the temperature regime and the ratio of the components of the reaction mixture are optimized. The developed test system was tested in terms of specificity and sensitivity using DNA from LSDV, sheep pox, goat pox, camel pox viruses and plasmids with inserts of LSDV gene fragments. The results of laboratory tests МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ И ГЕННАЯ ИНЖЕНЕРИЯ 33 №8 2021 Ғылыми журнал Научный журнал The scientific journal БИОҚАУІПСІЗДІК ЖӘНЕ БИОТЕХНОЛОГИЯ БИОБЕЗОПАСНОСТЬ И БИОТЕХНОЛОГИЯ BIOSAFETY AND BIOTECHNOLOGY showed that the test system works specifically, and the sensitivity is 20 attograms of plasmid DNA in one reaction, which corresponds to 5 copies of the DNA molecules of the LSDV

About the Authors

Н. Кожабергенов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


А. Тагайев
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


М. Абаева
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


К. Султанкулова
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


Е. Абдураимов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


А. Наханов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


К. Закарья
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Kazakhstan


References

1. Мищенко А.В., Мищенко В.А., Шевкопляс В. Н., Джаилиди Г.А., Дресвянникова С.Г., Черных О.Ю., Кононов А.В. Акбаев Р.М. Экологические особенности нодулярного дерматита крупного рогатого скота // Ветеринария Кубани. – 2017. – №5. – С. 22.

2. Roberts H. Lumpy skin disease in Turkey (Europeanside) Preliminary outbreak assessment. – URL:https://www.gov.uk/government/uploads/system/uploads/ attachment_data/file/437163/ poa-lumpy-skin-turkey-201506.pdf (accessed date: 18.04.16).

3. Семакина В.П., Жильцова М.В., Саввин А.В., Акимова Т.П. Распространение заразного узелкового дерматита (Нодулярного дерматита) крупного рогатого скота в мире // Ветеринария сегодня. – 2017. – №3 (22). – С. 13.

4. Gunenkov V.V. Lumpy skin disease in cattle // Collection of scientific papers of VGNKI. – 2005. – Vol.66. – P. 46-54.

5. Коновалов М.Г., Шевченко А.А. Профилактика нодулярного дерматита в Краснодарском крае // Материалы Всероссийской научно-практической конференции «Перспективы производства продуктов питания нового поколения». – 2017. – С. 15

6. Енгашев C., Смирнов Д., Алиев М. Нодулярный дерматит крупного рогатого скота // Ветеринария. – 2017. – С. 26-27

7. Lubinga J.C., Tuppurainen E.S., Coetzer J.A., Stoltsz W.H., Venter E.H. Evidence of lumpy skin disease virus over-wintering by transstadial persistence in Amblyomma hebraeum and transovarial persistence in Rhipicephalus decoloratus ticks // Exp. Appl. Acarol. – 2014. – Р. 77–90. DOI: 10.1007/s10493-013-9721–7

8. Santhamani R., Yogisharadhya R., Venkatesean G., Shivachandra S.B., Randey A.B., Ramakrishnan M.A. Molecular characterization of Indian sheeppox and goatpox viruses based on RPO30 and GPCR genes // Virus genes. 2014. –Р. 286–91. DOI 10.1007/s11262-014-1095-3

9. Tulman E.R., Afonso C.L., Lu Z., Zsak L., Kutish G.F., Rock D.L. Genome of lumpy skin disease virus // J. Virol. 2001. – Р. 7122–30. DOI: 10.1128/JVI.75.15.7122-7130.2001.

10. Monier A., Claverie J.M., Ogata H. Horizontal gene transfer and nucleotide compositional anomaly

11. in large DNA viruses // BMC Genomics. – 2007. –Р. 1–17. DOI: 10.1186/1471-2164-8-456.

12. Amin A.A., Ehab El-Nahas, Abd-Elbaset El-Mashed. Pathological and Virological Studies on an Outbreak of Lumpy Skin Disease among Cattle in Kalubia Governorate-Egypt // Journal of Advanced Veterinary Research. – 2015. –Р. 165-75.

13. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol. – 2016. – Р. 1870–4. DOI: 10.1093/molbev/msw054.

14. Beard P.M. Lumpy skin disease: a direct threat to Europe // Vet. Ec. – 2016. – Vol. 28. –P. 557-558.

15. Пестова Я.Е., Артюхова Е.Е., Кострова Е.Е., Шумилова И.Н., Кононов А.В., Спрыгин А.В. Разработка ПЦР в режиме реального времени для выявления полевых изолятов вируса заразного узелкового дерматита в пробах от крупного рогатого скота // Сельскохозяйственная биология. – 2018. – Т. 53 (2). – С. 422-429.

16. Кодекс здоровья наземных животных МЭБ. Гл. 1.2. Критерии включения болезней, инфекций и инфестаций в список МЭБ // Париж, 2014. – Т. 1. – 23 изд. – С. 5.

17. Lumpy skin disease are not detected in the territory of the country // Ekho –broadsheet. – URL: http://www. echo.az/article.php (accessed date: 18.04.16).


Review

For citations:


 ,  ,  ,  ,  ,  ,   DEVELOPMENT OF A REAL-TIME PCR TEST SYSTEM FOR THE DIAGNOSTICS OF BOVINE LUMPY SKIN DISEASE VIRUS. Biosafety and Biotechnology. 2021;(8). (In Russ.)

Views: 694


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2707-7241 (Print)
ISSN 2957-5702 (Online)