Preview

Биобезопасность и Биотехнология

Расширенный поиск

РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСА НОДУЛЯРНОГО ДЕРМАТИТА КРС НА ОСНОВЕ МЕТОДА ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ

Полный текст:

Аннотация

В настоящее время нодулярный дерматит (НД) является одним из наиболее вредоносных и экономически значимых заболеваний КРС во многих странах, в том числе и в Казахстане. В связи с неблагоприятной обстановкой в стране по данному виду заболевания требуется быстрая диагностика данного вируса для своевременного реагирования и принятия необходимых мер. Для решения этих задач разработана тест-система на основе метода полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ПЦР РВ). При разработке тест-системы применены современные молекулярно-биологические методы, с помощью которых определены наиболее консервативные и специфические участки GPCR гена вируса НД. С помощью выбранных участков сконструированы и синтезированы видоспецифичные пары праймеров и зондов. Для постановки ПЦР РВ оптимизирован температурный режим и соотношения компонентов реакционной смеси. Разработанная тест-система проверена по параметрам специфичности и чувствительности с применением ДНК вирусов НД, оспы овец, оспы коз, оспы верблюдов, и плазмид со вставками фрагментов гена вируса НД. Результаты лабораторных испытаний показали, что тест-система работает специфично, а чувствительность составляет 20 аттограмм плазмидной ДНК в одной реакции, что соответствует 5 копиям молекул ДНК вируса НД.

Об авторах

Н. С. Кожабергенов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


А. И. Тагайев
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


М. Р. Абаева
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


К. Т. Султанкулова
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


Е. О. Абдураимов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


А. К. Наханов
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


К. Д. Закарья
РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»
Казахстан


Список литературы

1. Мищенко А.В., Мищенко В.А., Шевкопляс В. Н., Джаилиди Г.А., Дресвянникова С.Г., Черных О.Ю., Кононов А.В. Акбаев Р.М. Экологические особенности нодулярного дерматита крупного рогатого скота // Ветеринария Кубани. – 2017. – №5. – С. 22.

2. Roberts H. Lumpy skin disease in Turkey (Europeanside) Preliminary outbreak assessment. – URL:https://www.gov.uk/government/uploads/system/uploads/ attachment_data/file/437163/ poa-lumpy-skin-turkey-201506.pdf (accessed date: 18.04.16).

3. Семакина В.П., Жильцова М.В., Саввин А.В., Акимова Т.П. Распространение заразного узелкового дерматита (Нодулярного дерматита) крупного рогатого скота в мире // Ветеринария сегодня. – 2017. – №3 (22). – С. 13.

4. Gunenkov V.V. Lumpy skin disease in cattle // Collection of scientific papers of VGNKI. – 2005. – Vol.66. – P. 46-54.

5. Коновалов М.Г., Шевченко А.А. Профилактика нодулярного дерматита в Краснодарском крае // Материалы Всероссийской научно-практической конференции «Перспективы производства продуктов питания нового поколения». – 2017. – С. 15

6. Енгашев C., Смирнов Д., Алиев М. Нодулярный дерматит крупного рогатого скота // Ветеринария. – 2017. – С. 26-27

7. Lubinga J.C., Tuppurainen E.S., Coetzer J.A., Stoltsz W.H., Venter E.H. Evidence of lumpy skin disease virus over-wintering by transstadial persistence in Amblyomma hebraeum and transovarial persistence in Rhipicephalus decoloratus ticks // Exp. Appl. Acarol. – 2014. – Р. 77–90. DOI: 10.1007/s10493-013-9721–7

8. Santhamani R., Yogisharadhya R., Venkatesean G., Shivachandra S.B., Randey A.B., Ramakrishnan M.A. Molecular characterization of Indian sheeppox and goatpox viruses based on RPO30 and GPCR genes // Virus genes. 2014. –Р. 286–91. DOI 10.1007/s11262-014-1095-3

9. Tulman E.R., Afonso C.L., Lu Z., Zsak L., Kutish G.F., Rock D.L. Genome of lumpy skin disease virus // J. Virol. 2001. – Р. 7122–30. DOI: 10.1128/JVI.75.15.7122-7130.2001.

10. Monier A., Claverie J.M., Ogata H. Horizontal gene transfer and nucleotide compositional anomaly

11. in large DNA viruses // BMC Genomics. – 2007. –Р. 1–17. DOI: 10.1186/1471-2164-8-456.

12. Amin A.A., Ehab El-Nahas, Abd-Elbaset El-Mashed. Pathological and Virological Studies on an Outbreak of Lumpy Skin Disease among Cattle in Kalubia Governorate-Egypt // Journal of Advanced Veterinary Research. – 2015. –Р. 165-75.

13. Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. Evol. – 2016. – Р. 1870–4. DOI: 10.1093/molbev/msw054.

14. Beard P.M. Lumpy skin disease: a direct threat to Europe // Vet. Ec. – 2016. – Vol. 28. –P. 557-558.

15. Пестова Я.Е., Артюхова Е.Е., Кострова Е.Е., Шумилова И.Н., Кононов А.В., Спрыгин А.В. Разработка ПЦР в режиме реального времени для выявления полевых изолятов вируса заразного узелкового дерматита в пробах от крупного рогатого скота // Сельскохозяйственная биология. – 2018. – Т. 53 (2). – С. 422-429.

16. Кодекс здоровья наземных животных МЭБ. Гл. 1.2. Критерии включения болезней, инфекций и инфестаций в список МЭБ // Париж, 2014. – Т. 1. – 23 изд. – С. 5.

17. Lumpy skin disease are not detected in the territory of the country // Ekho –broadsheet. – URL: http://www. echo.az/article.php (accessed date: 18.04.16).


Рецензия

Для цитирования:


Кожабергенов Н.С., Тагайев А.И., Абаева М.Р., Султанкулова К.Т., Абдураимов Е.О., Наханов А.К., Закарья К.Д. РАЗРАБОТКА ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ ВИРУСА НОДУЛЯРНОГО ДЕРМАТИТА КРС НА ОСНОВЕ МЕТОДА ПЦР В РЕЖИМЕ РЕАЛЬНОГО ВРЕМЕНИ. Биобезопасность и Биотехнология. 2021;(8).

For citation:


., ., ., ., ., ., . DEVELOPMENT OF A REAL-TIME PCR TEST SYSTEM FOR THE DIAGNOSTICS OF BOVINE LUMPY SKIN DISEASE VIRUS. Biosafety and Biotechnology. 2021;(8). (In Russ.)

Просмотров: 91


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2707-7241 (Print)