ПРАЙМЕРЛЕР СИНТЕЗІ ЖӘНЕ SARS-CoV-2 ВИРУСЫ B.1.1.7 (АЛЬФА) НҰСҚАСЫНЫҢ МАҢЫЗДЫ ГЕНДЕРДІН ӨҢДЕУ

Адамның коронавирус жұқтыру қауіпі өткен ғасырдың 60-жылдарында белгілі болды. Содан бері зоонозды коронавирустық инфекция адамдарға таралып, 21 ғасырдың басында екі үлкен індет болды. Адамдардың коронавирустық инфекцияны жұқтыру көрсеткіші тез таралды және әлемде үлкен алаңдаушылық тудырды. Коронавирустық инфекция уақыт өте келе әртүрлі генетикалық өзгерістерге ұшырады, нәтижесінде 2019 жылы Ухань қ. ҚХР коронавирустық инфекция адамдар арасында таралды. Әлемде коронавирустық инфекцияның кең таралуына байланысты ДДСҰ 2020 жылдың 11 наурызында пандемия жариялады. SARS-CoV-2 коронавирустық инфекциясы әлемнің 200-ге жуық елінде тіркелген және уақыт өте келе әртүрлі генетикалық өзгерістерге ұшырады. Генетикалық өзгерістерге байланысты 2020 жылдың күзінде Ұлыбританияда коронавирустық инфекцияның жаңа штаммы пайда болды. Коронавирустық инфекцияның генетикалық өзгеруін анықтау және оларды ажырату үшін біздің зертханада геномдық толық сиквенс жасау үшін 65 жұп праймер жасалынды. SARS-CoV-2 вирусының маңызды гендерін өңдеуге арналған арнайы праймерлер жасалды. Әзірленген праймерлер SARSCoV-2 вирустарының гендері туралы толық ақпарат алуға мүмкіндік береді. Ұсынылған праймерлерді SARS-CoV-2 вирусының толық геномын анықтау және идентификациялау үшін пайдалануға болады

1. Kahn J.S., McIntosh K. History and recent advances in coronavirus discovery. Pediatr Infect Dis J 24, Suppl: S223–S227, 2005. doi:10.1097/01.inf.0000188166.17324.60.

2. Weiss S.R., Navas-Martin S. Coronavirus pathogenesis and the emerging pathogen severe acute respiratory syndrome coronavirus. Microbiol Mol Biol Rev, 2005. – Р. 635-664. doi:10.1128/MMBR.69.4.635-664.2005

3. Lu G., Wang Q., Gao1 G.F. Bat-to-human: spike features determining ‘host jump’ of coronaviruses SARS-CoV, MERS-CoV, and beyond. Trends Microbiol. – 2015. – Р. 468–478.

4. Sarah L., Andrew L., Aviv O. COVID-19: A review of the proposed pharmacological treatments. European Journal of Pharmacology, 2020. – Vol.886. – Р. 173-251.

5. World Health Organization. WHO Director-General’s opening remarks at the media briefing on COVID-19 – 11 March 2020 [Internet]. Geneva (Switzerland): World Health Organization; 2020 [cited 2020 Mar 11]. Available from: https://www.who.int/

6. WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard. https://covid19.who.int/table

7. Tracking SARS-CoV-2 variants https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2 variants/

8. Explained: Why WHO named Covid-19 variants first found in India as ‘Kappa’ and ‘Delta’ | India News ‑ Times of India (англ.). The Times of India. Дата обращения: 20 января 2022.

9. WHO announces simple, easy-to-say labels for SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern (англ.). www.who.int. Дата обращения: 20 января 2022

10. Rambaut A., Loman N., Pybus O., Barclay W., Barrett J., Carabelli A., Connor T., Peacock T., Robertson D.L., Volz E. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations.

11. Inside the B.1.1.7 Coronavirus Variant. https://www.nytimes.com/interactive/2021/health/coronavirus-mutations-B117-variant.html

12. Li D., Zhang J., Li J. Primer design for quantitative real-time PCR for the emerging Coronavirus SARS-CoV-2. Theranostics, 2020. – Р. 7150-62. https://doi.org/10.7150/thno.47649