СИНТЕЗ ПРАЙМЕРОВ И НАРАБОТКА ЗНАЧИМЫХ ГЕНОВ B.1.1.7 (АЛЬФА) ВАРИАНТА ВИРУСА SARS-CoV-2

Угроза заражения человека коронавирусом стала известна еще в 60-х годах прошлого века. С тех пор зоонозная коронавирусная инфекция распространилась среди людей и в начале 21-го века было две крупные эпидемии. Показатель заражения людей коронавирусной инфекцией быстро распространился и вызвал серьезную обеспокоенность в мире. Коронавирусная инфекция со временем претерпела различные генетические изменения, в результате в 2019 году в городе Ухань, КНР коронавирусная инфекция распространилась среди людей. Из-за широкого распространения коронавирусной инфекции в мире ВОЗ объявила пандемию 11 марта 2020 года. Коронавирусная инфекция SARS-CoV-2 зарегистрирована около в 200 странах мира и со временем претерпела различные генетические изменения. Из-за генетических изменений в Великобритании осенью 2020 года появился новый штамм коронавирусной инфекции. Для определения генетических изменений коронавирусной инфекции и для их различения, в нашей лаборатории было разработано 65 пар праймеров для получения полного геномного сиквенса. Разработаны специальные праймеры для наработки значимых генов вируса SARS-CoV-2. Разработанные праймеры позволяют получить полную информацию о генах вирусов SARS-CoV-2.

Представленные праймеры можно использовать в целях идентификации и наработки полного генома вируса SARS-CoV-2.

1. Kahn J.S., McIntosh K. History and recent advances in coronavirus discovery. Pediatr Infect Dis J 24, Suppl: S223–S227, 2005. doi:10.1097/01.inf.0000188166.17324.60.

2. Weiss S.R., Navas-Martin S. Coronavirus pathogenesis and the emerging pathogen severe acute respiratory syndrome coronavirus. Microbiol Mol Biol Rev, 2005. – Р. 635-664. doi:10.1128/MMBR.69.4.635-664.2005

3. Lu G., Wang Q., Gao1 G.F. Bat-to-human: spike features determining ‘host jump’ of coronaviruses SARS-CoV, MERS-CoV, and beyond. Trends Microbiol. – 2015. – Р. 468–478.

4. Sarah L., Andrew L., Aviv O. COVID-19: A review of the proposed pharmacological treatments. European Journal of Pharmacology, 2020. – Vol.886. – Р. 173-251.

5. World Health Organization. WHO Director-General’s opening remarks at the media briefing on COVID-19 – 11 March 2020 [Internet]. Geneva (Switzerland): World Health Organization; 2020 [cited 2020 Mar 11]. Available from: https://www.who.int/

6. WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard. https://covid19.who.int/table

7. Tracking SARS-CoV-2 variants https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2 variants/

8. Explained: Why WHO named Covid-19 variants first found in India as ‘Kappa’ and ‘Delta’ | India News ‑ Times of India (англ.). The Times of India. Дата обращения: 20 января 2022.

9. WHO announces simple, easy-to-say labels for SARS-CoV-2 Variants of Interest and Concern (англ.). www.who.int. Дата обращения: 20 января 2022

10. Rambaut A., Loman N., Pybus O., Barclay W., Barrett J., Carabelli A., Connor T., Peacock T., Robertson D.L., Volz E. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations.

11. Inside the B.1.1.7 Coronavirus Variant. https://www.nytimes.com/interactive/2021/health/coronavirus-mutations-B117-variant.html

12. Li D., Zhang J., Li J. Primer design for quantitative real-time PCR for the emerging Coronavirus SARS-CoV-2. Theranostics, 2020. – Р. 7150-62. https://doi.org/10.7150/thno.47649