ASPERGILLUS FLAVUS-Ті ПОЛИМЕРАЗДЫ ТІЗБЕКТІ РЕАКЦИЯ ӘДІСІМЕН ИНДИКАЦИЯЛАУ ЖӘНЕ АНЫҚТАУ ҮШІН СЫНАҚ ЖҮЙЕСІН СЫНАҚТАН ӨТКІЗУ «НАҚТЫ УАҚЫТ» РЕЖИМІНДЕ

мақалада Aspergillus flavus микроскопиялық саңырауқұлақтарын «нақты уақыт режимінде»анықтаумен полимеразды тізбекті реакция әдісімен индикациялау және анықтау үшін сынақ жүйесін сынақтан өткізу бойынша зерттеу нәтижелері келтірілген. Multiple Sequence Alignment Viewer 1.22.1 және ugena 44.0 бағдарламалық жасақтамасын қолдану. A. flavus сынақ жүйесіне арнайы праймерлер кіреді: тікелей праймер (f) 5’-3’ GGGCCCGCAAGAATAC, кері праймер (r) 3’-5’ ACGAGTTGTCACCTTCCCGAGA; флуоресцентті бояу: HEX, зонд - CGGTTCGCTTTGTCATCGT, bhq2 сөндіргіш. Реакция ХАТТАМАСЫ: алдын ала денатурация-95 0C - 5 минут (1 цикл); денатурация - 95 0C - 5 сек, күйдіру - 60 0C-15 сек (50 цикл). Зонд: AGCATAGGCTGATGCTCGTAGGC, флуоресцентті бояу – ROX, сөндіргіш-BHQ-2. Тест жүйесінің сезімталдығы-1000 жасуша. Праймерлердің оңтайлы концентрациясы бір реакцияға әр праймердің 9 рМ-ге тең. Зондтың оңтайлы концентрациясы-0,4 pM. Нәтижелер дихотомиялық кілттерді қолдану A. flavus фитопатогенді саңырауқұлақтарын мүмкіндігінше дәл ажыратуға мүмкіндік бермейтінін көрсетеді. Изоляттарды сәйкестендірудің жаңа тәсілі 15 оқшауланған штаммның A. flavus түріне жататындығын растады, 20 жүгері сынамасынан оқшауланған, тамырдың ыдырауы және солуы ретінде көрінетін және мәдени-морфологиялық қасиеттерін зерттеу негізінде Aspergillus ретінде алғаш рет терілген. Зерттеу тақырыптық жоспарға сәйкес жүргізілді – Ресей Федерациясы Ауыл шаруашылығы министрлігінің тапсырмасы, ғылыми-зерттеу институтының тіркеу нөмірі 122030200367-8.

1. Amaike S., Keller N. P. Aspergillus flavus // Annual review of phytopathology. – 2011. – Vol. 49. – No. 1. – P. 107-133.

2. Gourama H., Bullerman L. B. Aspergillus flavus and Aspergillus parasiticus: Aflatoxigenic fungi of concern in foods and feeds: A review // Journal of Food protection. – 1995. – Vol. 58. – No. 12. – P. 1395-1404.

3. Rudramurthy S. M. et al. Invasive aspergillosis by Aspergillus flavus: epidemiology, diagnosis, antifungal resistance, and management // Journal of Fungi. – 2019. – Vol. 5. – No. 3. – P. 55.

4. Cho H. J. et al. Regulation of Conidiogenesis in Aspergillus flavus // Cells. – 2022. – Vol. 11. – No. 18. – P. 2796.

5. Билай В.И., Коваль Э.З. Аспергиллы. – Киев: Наукова думка, 1988. – 204 с.

6. Билай В.И. Основы общей микологии. – Киев, Вища школа, 1980. – 360 с.

7. Рябинин И.А. Разработка ключа для видовой идентификации Aspergillus spp. – возбудителей заболеваний человека, циркулирующих в Северо-Западном округе России / И.А. Рябинин, С.С. Расулова // «Профилактическая медицина-2017»: сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. 6–7 декабря 2017 года. Ч. 2. – СПб.: Изд-во СЗГМУ им. И.И. Мечникова, 2017. – 312 с.

8. Klich M.A. Identification of common Aspergillus species. – Utrech: Centraalbureeau voor Schimmelculture, 2002. – 116 p.

9. Стахеев А.А. Молекулярно-генетические методы в исследовании таксономии и специфической идентификации токсинпродуцирующих грибов рода Fusarium: успехи и проблемы / А.А. Стахеев, Л.В. Самохвалова, Д.Ю. Рязанцев, С.К. Завриев // Сельскохозяйственная биология. – 2016. – Т. 51. – №3. – С. 275-284.

10. Игнатьева С.М. Апробация мультиплексной тест-системы «HRM-Zygo-Asp» на клиническом материале больных мукормикозами / С.М. Игнатьева, В.А. Спиридонова, Т.С. Богомолова, Ю.Л. Авдеенко, Ю.В. Борзова, С.Н. Хостелиди, О.В. Шадривова, М.О. Попова, Ю.А. Чудиновских, И.С. Зюзгин, О.С. Успенская, Н.В. Васильева // Проблемы медицинской микологии. – 2019. – Т. 21. – №4. – С. 36-42.