<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="research-article" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">biob</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Биобезопасность и Биотехнология</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Biosafety and Biotechnology</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2707-7241</issn><issn pub-type="epub">2957-5702</issn><publisher><publisher-name>Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">biob-10</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>МИКРОБИОЛОГИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>MICROBIOLOGY</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>ОПТИМИЗАЦИЯ КОМПОНЕНТНОГО СОСТАВА РЕАКЦИОННОЙ СМЕСИ ПЦР ДЛЯ НАРАБОТКИ МИКОБАКТЕРИАЛЬНЫХ ГЕНОВ</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>OPTIMIZATION OF THE PCR REACTION MIXTURE COMPONENT COMPOSITION FOR THE OBTAINING OF MYCOBACTERIAL GENES</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Абай</surname><given-names>Ж. С.</given-names></name></name-alternatives><email xlink:type="simple">abaizh097@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Нурпейсова</surname><given-names>А. С.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Абитаев</surname><given-names>Р. Т.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Абитаев</surname><given-names>Р. Т.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Токкарина</surname><given-names>Г. Б.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Шораева</surname><given-names>К. А.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Джекебеков</surname><given-names>К. К.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Касенов</surname><given-names>М. М.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Закарья</surname><given-names>К. Д.</given-names></name></name-alternatives><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff-1"><aff xml:lang="ru">РГП «Научно-исследовательский институт проблем биологической безопасности»<country>Казахстан</country></aff></aff-alternatives><pub-date pub-type="collection"><year>2021</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>03</day><month>11</month><year>2022</year></pub-date><volume>0</volume><issue>8</issue><fpage>49</fpage><lpage>54</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Абай Ж.С., Нурпейсова А.С., Абитаев Р.Т., Абитаев Р.Т., Токкарина Г.Б., Шораева К.А., Джекебеков К.К., Касенов М.М., Закарья К.Д., 2022</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Абай Ж.С., Нурпейсова А.С., Абитаев Р.Т., Абитаев Р.Т., Токкарина Г.Б., Шораева К.А., Джекебеков К.К., Касенов М.М., Закарья К.Д.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Абай Ж.С., Нурпейсова А.С., Абитаев Р.Т., Абитаев Р.Т., Токкарина Г.Б., Шораева К.А., Джекебеков К.К., Касенов М.М., Закарья К.Д.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journal.biosafety.kz/jour/article/view/10">https://journal.biosafety.kz/jour/article/view/10</self-uri><abstract><p>Туберкулез крупного рогатого скота – инфекционное респираторное заболевание крупного рогатого скота без особых клинических признаков, вызванное бактерией Mycobacterium bovis (M. bovis), которая может преодолевать межвидовой барьер, заражать и вызывать заболевания у многих других диких и домашних животных. Иммунизация крупного рогатого скота путем вакцинации является стандарттной профилактической мерой при борьбе с туберкулезом. Единственной доступной в настоящее время вакциной против туберкулеза человека и крупного рогатого скота является живая аттенуированная бацилла Кальметта-Герена (БЦЖ) и ее модифицированные варианты. Необходимость разработки отечественной вакцины, обеспечивающую более высокую и устойчивую защиту, чем вакцина БЦЖ, является актуальной. И целью данной работы является выбор оптимального компонентного состава реакционной смеси ПЦР для наработки протективных белков M. bovis Esat-6 и TB10.4. В результате работ по оптимизации постановки ПЦР для наработки микобатериальных генов M. bovis использовали в составе реакционной смеси Taq ДНК полимеразу, содержащую MgCl2 – 0,3 мкл; 10х ПЦР-буфер – 2,5 мкл; специфические праймеры (20 пМ) по 1 мкл каждой, смесь dNTP (10 мМ) – 1 мкл; целевая ДНК – 5 мкл в общем объеме 25 мкл при оптимизированном режиме: 94°C – 5 мин, 94°C – 1 мин, 55/62°C – 40 сек, 72°C – 1,30 мин (35 циклов), и 72°C – 7 мин, 4°C – охлаждение и хранение бесконечно</p></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>Bovine tuberculosis is an infectious respiratory disease of cattle without specific clinical signs, caused by the bacterium Mycobacterium bovis (M. bovis), which can cross the species barrier, infect and cause disease in many other wild and domestic animals. Immunization of cattle by vaccination is a standard preventive measure in the fight against tuberculosis. The only currently available vaccine against human and bovine tuberculosis is live attenuated Bacillus Calmette-Guérin (BCG) and its modified variants. The need to develop a domestic vaccine that provides higher and more stable protection than the BCG vaccine is relevant. And the purpose of this work is to select the optimal component composition of the PCR reaction mixture for the production of protective proteins M. bovis Esat-6 and TB10.4. As a result of work to optimize the PCR setting for the obtaining mycobacterial genes of M. bovis, Taq DNA polymerase containing MgCl2 – 0.3 μl; 10x PCR buffer – 2.5 µl; specific primers (20 pM) – 1 µl each, dNTP mixture (10 mM)-1 µl; target DNA – 5 µl were used as part of the reaction mixture in a total volume of 25 µl with optimized mode: 94°C – 5 min, 94°C – 1 min, 55/62°C – 40 sec, 72°C – 1.30 min (35 cycles), and 72°C – 7 min, 4°C – cooling and storage indefinitely</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>туберкулез крупного рогатого скота</kwd><kwd>вакцина</kwd><kwd>M.bovis</kwd><kwd>полимеразная цепная реакция</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="en"><kwd>bovine tuberculosis</kwd><kwd>vaccine</kwd><kwd>M. bovis</kwd><kwd>polymerase chain reaction</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title><ref id="cit1"><label>1</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Pollock J.M., Neill S.D. Mycobacterium bovis infection and tuberculosis in cattle // Vet J. – 2002. – Р. 115-127.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Pollock J.M., Neill S.D. Mycobacterium bovis infection and tuberculosis in cattle // Vet J. – 2002. – Р. 115-127.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit2"><label>2</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Abbate J.M., Arfuso F., Iaria C., Arestia G., Lanteri G. Prevalence of Bovine Tuberculosis in Slaughtered Cattle in Sicily, Southern Italy // Animals (Basel). – 2020. – 1473 p.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Abbate J.M., Arfuso F., Iaria C., Arestia G., Lanteri G. Prevalence of Bovine Tuberculosis in Slaughtered Cattle in Sicily, Southern Italy // Animals (Basel). – 2020. – 1473 p.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit3"><label>3</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Muller B., Durr S., Alonso S., Hattendorf J., Laisse C.J., Parsons S.D., van Helden P.D., Zinsstag J. Zoonotic Mycobacterium bovis-induced tuberculosis in humans // Emerg. Infect. Dis. – 2013. – Р. 899-908.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Muller B., Durr S., Alonso S., Hattendorf J., Laisse C.J., Parsons S.D., van Helden P.D., Zinsstag J. Zoonotic Mycobacterium bovis-induced tuberculosis in humans // Emerg. Infect. Dis. – 2013. – Р. 899-908.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit4"><label>4</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Hewinson R.G., Vordermeier H.M., Smith N.H., Gordon S.V. Recent advances in our knowledge of Mycobacterium bovis: a feeling for the organism // Vet Microbiol. – 2006. – Р. 127–139.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Hewinson R.G., Vordermeier H.M., Smith N.H., Gordon S.V. Recent advances in our knowledge of Mycobacterium bovis: a feeling for the organism // Vet Microbiol. – 2006. – Р. 127–139.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit5"><label>5</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Domingo M., Vidal E., Marco A. Pathology of bovine tuberculosis // Res Vet Sci. – 2014. – Р. 20-29.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Domingo M., Vidal E., Marco A. Pathology of bovine tuberculosis // Res Vet Sci. – 2014. – Р. 20-29.</mixed-citation></citation-alternatives></ref><ref id="cit6"><label>6</label><citation-alternatives><mixed-citation xml:lang="ru">Абитаев Р.Т., Шораева К.А., Нурпейсова А.С., Сырым Н.С., Абай Ж.С., Джекебеков К.К., Сармыкова М.К., Еспембетов Б.А., Касенов М.М. Подбор и синтез праймеров для наработки генов, кодирующих протективные белки M. Bovis // Евразийское Научное Объединение. Ветеринарные науки. – 2021. – С. 159-164.</mixed-citation><mixed-citation xml:lang="en">Абитаев Р.Т., Шораева К.А., Нурпейсова А.С., Сырым Н.С., Абай Ж.С., Джекебеков К.К., Сармыкова М.К., Еспембетов Б.А., Касенов М.М. Подбор и синтез праймеров для наработки генов, кодирующих протективные белки M. Bovis // Евразийское Научное Объединение. Ветеринарные науки. – 2021. – С. 159-164.</mixed-citation></citation-alternatives></ref></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
